При производстве препарата пробиотика биоспорин нет отходов, подлежащих переработке с последующим их использованием. В производстве образуются потери, которые подлежат обеззараживанию. К ним относятся использованы питательные среды в микробиологическом посуде после выращивания промышленных микроорганизмов и тест-микробов.

Обеззараживанию подлежат отбракованные ампулы с препаратом для предотвращения обсемененности производств других препаратов. Для предотвращения этого отработанные питательные среды и отбракованные ампулы подлежат обеззараживанию в камере Крупин в течение 60 минут при температуре +121 и давлении 0,11 МПа. При производстве биоспорина нет технологических выбросов, которые обеззараживаются на производстве. Технологический процесс должен осуществляться в соответствии с требованиями технологического регламента и при следовании на рабочих местах инструкций по технике безопасности. Микробные штаммы Bacillus subtilis 3 и Bacillus licheniformis 31, которые используются в производстве биоспорин согласно ГЭП 9.9.5.035.99 (Безопасность работ по микроорганизмам) не входят в перечень микроорганизмов 1-4 групп патогенности, поэтому не опасны для здоровья людей, также не входят в «Перечень ядовитых веществ» в том числе «токсичных промышленных отходов, продуктов биотехнологии». Таким образом, штаммы являются эпидемиологически-и экологически безопасными. Работа с этими микробными штаммами безвредна, но производство требует соблюдения санитарно-гигиенических правил, например на предотвращение возможности заражения препарата посторонними микроорганизмов, а также микробной контаминацией производственных помещений других цехов предприятия. Поэтому каждый работник проходит инструктаж на рабочем месте и регистрацию в журнале. Работа с культурами должна проводиться в боксах, в которых до и после работы делают влажную уборку с использованием 6% раствора перекиси водорода с моющим средством. Руки обязательно обрабатывают мылом, а затем дезсредств (первомур, спирт этиловый, Стерилиум) до и после работы с микроорганизмами. Персонал должен иметь специальный стерильный защитную одежду. В случае попадания культуры на пол, или какой - либо предмет, загрязненное место обрабатывают ватным тампоном, смоченным 6% раствором перекиси водорода с моющим средством и оставляют на 3-4 часа, после чего тщательно вытереть тряпкой, смоченной 6% раствором перекиси водорода с моющим средством. При попадании культуры на руки, их обрабатывают тампоном, смоченным 76% спиртом и моют щеткой, теплой водой с мылом. При попадании культуры на защитную одежду его замачивают на 30-60 минут в емкости с дезинфицирующим, стирают и стерилизуют. После завершения работы обсемененный материал обжигают в пламени горелки или погружают в емкость с дезинфицирующим на 18-20 часов после чего их моют и сдают на стерилизацию. При работе с баллонами, которые находятся под давлением, на них надевают специальные стерильные футляры из толстой материи со шнурком. Пробирки, которые закрывают ватными пробками должны иметь обпаянные конце. Запрещено закрывать пробками баллоны, пробирки, имеющие трещины, а также их использовать. Основные вещества полупродукты, готовый продукт не является пожароопасным и не обладает токсическим действием. Опасными производственными факторами, которые могут возникнуть при эксплуатации оборудования и ведении технологического процесса производства биоспорин являются: